1、有机污染物

粪便中含有大量的碳化合物、含氨化合物等腐败有机物，这些物质进入水体后，使水变黄、变臭，并在微生物的作用下，将使水体变质，变臭，将不能饮用。

2、氮、磷营养物质污染

氮、磷是养鸡排泄物的主要营养物质污染物。在有机分解过程中，有机物氮、磷还要被矿化为无机的氮、磷。多数含氮化物被氧化成硝酸盐，其中一部分滞留在表土层，另一部分则渗入地下，日积月累则会污染地下水源。含磷过多的污水流入河沟和池塘，使水体富营养化，可使藻类等浮游生物大肆繁殖疯长，导致水中溶解氧含量降低并产生多种毒素，直接影响鱼类生长。

3、矿物质元素污染

在畜禽养殖行业，为增强畜禽的食欲，往往在饲料中加入食盐，这导致粪尿盐分含量增多，直接影响动物健康和畜产品的食用安全，污染土壤，对农作物的生长不利。该项目的实施，将有助于改善畜禽粪便对土壤和水体的污染。鸡粪中含砂量较高，特别是种鸡粪，饲料中砂砾与贝壳的添加量就有8%，经过消化道带入粪便中。